您好，首先需要区分该套公租房的性质，按照公租房性质来确定处理方案。

（1）若男方申请的是政府直管公房，一般来说双方都有权利承租，双方能够达成协议，则按照协议处理；若不能达成协议，向法院起诉，由法院根据照顾抚养子女一方、无过错方、照顾女方及残疾一方为原则进行处理。

（2）若男方申请的是企业自管公房且男方是该单位的职员，女方不是该公司职工，原则上是由本单位职员一方继续承租，女方不能承租，当然单位同意由非单位职工的女方承租也是可以的。如果男方申请的企业自管公房，男女双方都是单位职工，双方都具有承租权，不能达成协议的话，由法院根据照顾抚养子女一方、无过错方、照顾女方及残疾一方为原则进行处理。

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